Lagos ácidos tendem a ter águas claras, porque contêm pouca ou nenhuma alga. Também podem não conter peixes.
Existe uma forte relação entre baixos níveis de pH e a perda de populações de peixes nos lagos do nosso planeta. Com um pH abaixo de 4,5, praticamente nenhum peixe sobrevive, enquanto níveis iguais a 6 ou superiores promovem populações saudáveis.
Ácidos na água inibem a produção das enzimas que permitem que as larvas de truta escapem das suas ovas. O baixo pH também faz circular metais pesados, como o alumínio, nos lagos. O alumínio faz com que alguns peixes produzam muco em excesso ao redor de suas guelras, prejudicando a respiração. O crescimento de fitoplâncton é inibido pelos grandes níveis de acidez e animais que se alimentam deles são prejudicados. Assim, o baixo pH pode trazer prejuízos enormes ao meio ambiente pois tende a matar a fauna e a flora aquáticas.